锰砂滤料的工作原理是铁以Fe2+的状态曾于地下（井）水中，水会有异色和异味，从而会降低污染离子交换树脂的能力，长时间它会形成腐蚀设备的铁垢，而且影响传热。而锰砂滤料中的MnO2与Fe2+会发生氧化还原反应，将会使Fe2+变为Fe3+并生成 Fe(OH)3的沉淀，去除净化的目的就是利用锰砂过滤器的反冲洗功能所达到的。如果含有铁和锰的水长期通过滤料表面时，它在滤料表面就会形成铁质和锰质滤膜。因为该性滤料对铁、锰的吸附能力很强，所以在经过该性滤料时就可以缩短铁质、锰质滤膜的形成时间，如果是在自然条件下形成的铁质滤膜那么就会需要很长的时间，形成锰质滤膜的时间也会更久。一般因为所形成的铁质滤膜和锰质滤膜对去除铁和锰都具有催化的作用，所以我们称之为“活性滤膜”。

        天然的锰砂滤料是用于地下水除铁和除锰的，氧化锰是以锰的形态为主。它的含锰量一般不会小于35%的天然锰砂滤料，它既可以用于地下水处理中除铁，也可用于地下水处理中除锰；假如是含锰量为20%～30%之间的天然锰砂滤料，那么它就会只适合用于地下水中除铁；如果是含锰量小于20%的锰矿砂是不宜采用的。所以在使用时应优先采用经过科学试验的锰砂滤料或者是具有良好的除铁和除锰生产效果使用证明的天然锰砂滤料产品。

        在使用过程中天然锰砂滤料的盐酸可溶率不能大于3.5%（百分率按质量计，下同），破碎率和磨损率之和不能大于3%。而且不能含有肉眼可见泥土、页岩和外来碎屑，含泥量不能大于2.5%。天然锰砂滤料在使用中如果对密度没有特殊要求的，它的平均密度一般为3.2g/cm3至3.6g/cm3范围内。